Пара слов об AlphaFold2
Несколько мыслей о событии, расколовшем мир вычислительных биологов на непримиримые лагеря.…
Lean: introduction
В текущей серии постов я хочу уложить некоторые вещи в собственной голове, получить простую шпаргалку на русском языке, а также помочь проникнуться системой тем, кому по какой-то неведомой причине влом читать книжку, что тем не менее сделать обязательно нужно.…
Магистратура в ВШЭ, COVID и черные списки
Мы решили открыть магистратуру "Вычислительная биология и биоинформатика" в Питерской Вышке. Для того, чтобы прорекламировать направление решили откровенно хайпануть на теме COVID-19.…
Сборка проекта в web-разработке
Пытаюсь разобраться с проектом на JavaScript. Так как до этого я веб-разработкой никогда не занимался, меня сильно смутил весь окружающий её тулинг. Этой заметкой я хочу зафиксировать свой путь создания простейшего проекта.…
О кодировании натуральных чисел (часть 1)
Широко известно классическое индуктивное объявление натуральных чисел: ноль — натуральное число, и число следующее за натуральным — натуральное. Простейший способ кодирования таких чисел при помощи лямбда-исчисления — метод Чёрча, не имеющий, как кажется, прямого отношения к индуктивному типу.…
Untyped Lambda Calculus
Попытка cделать описание лямбда-исчисления сразу с реализацией кода на языке программирования Haskell.…
Как мы нашли белок
С 30 апреля по 4 мая проходила моя любимая ежегодная конференция PEGS Boston. На протяжении 14 лет в дизайне логотипа и всех сопутствующих материалов этой конференции используется изображение одного и того же белка, и вот уже 13 лет подряд организаторы конференции задают вопрос: что это за белок?…
Bayesian optimization for small molecule hit generation
Выступил на зимней школе Future Biotech про методы работы с малыми молекулами. Так как велась прямая трансляция, можно сразу выложить видео. Слайды можно посмотреть и скачать на F1000.…